Автоматизуйте аналіз 10x Genomics Cloud через Neotask на Neotask
Запускайте та відстежуйте конвеєри аналізу секвенування одиночних клітин
Переглядайте, завантажуйте та організовуйте геномічні датасети та результати
Запитуйте метадані експериментів та діліться результатами між командами
Що ви можете робити
Neotask підключається до 10x Genomics Cloud через Neotask, надаючи дослідникам розмовний контроль над робочими процесами одноклітинної та просторової геноміки - без навігації складними панелями управління.
Управління конвеєрами
Запуск конвеєрів аналізу - запускайте робочі процеси Cell Ranger, Space Ranger або Loupe Browser, описуючи параметри експерименту звичайною мовою
Моніторинг статусу виконання - перевіряйте, які конвеєри працюють, в черзі або завершені, та виявляйте помилки без входу в хмарну консоль
Отримання результатів - витягуйте результати аналізу, метрики QC та підсумкові звіти для завершених запусків
Повторний запуск невдалих завдань - визначайте невдалі кроки конвеєра та повторно надсилайте з виправленими параметрами
Операції з датасетами
Перегляд датасетів - показуйте всі датасети у вашому робочому просторі з фільтрацією за проектом, типом зразка або датою
Завантаження результатів - отримуйте конкретні файли результатів, такі як відфільтровані матриці feature-barcode або результати зображень тканин
Організація проектів - створюйте папки проектів, переміщуйте датасети та підтримуйте узгоджені конвенції найменування масштабно
Порівняння експериментів - витягуйте метадані з кількох запусків для порівняння кількості клітин, глибини секвенування та метрик якості поряд
Співпраця та звітність
Поширення датасетів - генеруйте посилання для поширення або додавайте співпрацівників до конкретних проектів
Експорт підсумків - витягуйте підсумки експериментів у структурованих форматах для звітів або інструментів подальшого аналізу
Відстеження походження зразків - запитуйте, які зразки отримані з яких вихідних бібліотек та які версії аналізу використовувалися
Спробуйте запитати
"Покажи всі завершені запуски Cell Ranger за цей місяць"
"Яка кількість клітин та медіана генів на клітину для мого останнього запуску scRNA-seq?"
"Завантаж відфільтровану матрицю feature-barcode для зразка SRS_001"
"Перезапусти конвеєр для зразка ID xyz з версією хімії 3"
"Покажи всі датасети в проекті Мікрооточення пухлини"
"Які з моїх останніх запусків не пройшли QC і яка була причина?"
"Порівняй насичення секвенування по моїх останніх 5 запусках"
"Додай мого колегу [email] як співпрацівника в проект Просторова транскриптоміка"
Поради
Neotask на Neotask може перехресно порівнювати результати 10x Genomics Cloud з вашим лабораторним журналом або інструментами подальшого аналізу - попросіть узагальнити запуск та автоматично додати нотатку у ваш Notion або Google Doc
Для великих когорт експериментів просіть пакетні підсумки замість запитів по одному - "дай мені таблицю всіх запусків за квартал з кількістю клітин та коефіцієнтом картування"
Поєднуйте з обчислювальними інтеграціями через Neotask: запустіть конвеєр 10x, моніторте його та сповістіть ваш канал Slack після завершення
Використовуйте структуровані запити для контролю порогів QC: "покажи всі зразки, де насичення секвенування нижче 50%" виявляє проблемні запуски до початку подальшого аналізу
Multiple workspaces and capacity for larger teams.
Works Well With
Google Drive - Automate 10x Genomics data sync to Google Drive. Streamline genomics workflows, store research files in the cloud, and c...
Більше інтеграцій Освіта
italki language learning - Browse language teachers and book one-on-one or group lessons across more than 150 languages based on your schedule, level, and budget.
Coursera - Шукайте, записуйтесь та відстежуйте навчання на Coursera через розмову - Neotask використовує Neotask для спрощення професійного розвитку.
Udemy - Знаходьте, оцінюйте та відстежуйте курси Udemy через природну розмову - Neotask та Neotask спрощують навігацію у найбільшому торговому майданчику курсів у світі.
ZZAIM - ZZAIM is aimed squarely at teachers working from Korea's official K-12 curriculum standards: it lets you search those standards by subject…
Duolingo - Прискоріть практику Duolingo через розмову - Neotask використовує Neotask для допомоги у швидшому та розумнішому вивченні мов.
Google Classroom - Neotask автоматизує адміністрування Google Classroom - агенти Neotask керують курсами, завданнями та студентами, звільняючи викладачів від рутини.